Algum dia, um grupo de colegas de turma fará um charme à noite depois da aula - o feitiço Happy Sachiko. Este ritual de boneca de papel é feito para torná-los amigos para sempre, mas executá-lo incorretamente irá levá-los para ser arrastado para um fantasma em ruínas de Tenjin Elementary School, que tinha sido demolido anos atrás. Presos até que eles possam se reunir e executar o encanto corretamente, os alunos terão que resolver o mistério da escola assombrada, a fim de torná-lo vivo. Antes desse evento malfadado, no entanto, os amigos levavam vidas comuns. Corpse Party: Missing Footage revela um insight sobre a vida dos estudantes no dia anterior ao de um pesadelo.
